Выстроенные позже каменные храмы и особенно надвратная колокольня являются лучшими созданиями русских зодчих, хоть имена их остались неизвестными. Монастырь прославился в народе святыми мощами и чудотворными иконами – Святой Великомученицы Екатерины, подарком государя Алексея Михайловича к освящению монастыря, и Священномученика Антипы. В памяти народной остались имена выдающихся строителей и настоятелей пустыни Мелхиседека, Мисаила и смиренных старцев Иакова и Нифонта, принимавших богомольцев для духовных бесед и наставлений.
Еще до закрытия Екатерининской пустыни в 1931-1934 годах в ее стенах обосновалась тюрьма для уголовников, затем, в течение трех с половиной лет, проживали рабочие подсобного хозяйства дома отдыха архитекторов «Суханово», а с 1939 года здесь была оборудована печально известная секретная политическая тюрьма МГБ – Сухановка. Десятки тысяч страдальцев прошли через ее застенки. Ни один не был освобожден; некоторые умерли здесь под пытками, другие – расстреляны или осуждены на долгие годы лагерей.
После закрытия тюрьмы в 1952 году какое-то время здесь находилась тюремная областная больница, затем Учебный центр ГУВД МО. Лишь с 1992 года началась поэтапная передача строений монастыря Русской Православной Церкви. Постепенно были отреставрированы все церковные, жилые и хозяйственные помещения.
Ныне Свято-Екатерининский мужской монастырь, пройдя через все потрясения ХХ века, возродился к христианской жизни. В 2017 году обитель отмечает 25-летие возрождения монашеской жизни. Насельники ведут большую общественную и духовно-просветительскую работу среди населения. Монастырь радует прихожан и паломников ухоженной территорией с прекрасными цветниками. Каждого приходящего здесь встречают с радушием и сердечным гостеприимством. В обители и на его подворьях не умолкает молитва. Ежедневно поминаются все пострадавшие на месте сем.
